Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc15Q8C9M2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc15Q8C9M2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc15Q8C9M2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms