Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc90bQ8C3X2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc90bQ8C3X2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms