Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csgalnact2Q8C1F4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csgalnact2Q8C1F4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csgalnact2Q8C1F4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms