Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slx1bQ8BX32 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Slx1bQ8BX32 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slx1bQ8BX32 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx1bQ8BX32 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms