Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab11fip4Q8BQP8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab11fip4Q8BQP8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab11fip4Q8BQP8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms