Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zcchc4Q8BKW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zcchc4Q8BKW4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms