Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D130040H23RikQ8BII3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D130040H23RikQ8BII3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms