Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cnot10Q8BH15 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot10Q8BH15 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot10Q8BH15 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms