Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms