Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NfascQ810U3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NfascQ810U3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms