Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim19Q80ZU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim19Q80ZU4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms