Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2q1Q7TSS2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2q1Q7TSS2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms