Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Eci3Q78JN3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Eci3Q78JN3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Eci3Q78JN3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms