Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssh1Q76I79 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh1Q76I79 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh1Q76I79 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh1Q76I79 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms