Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Higd1cQ76I25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Higd1cQ76I25 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms