Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpv1Q704Y3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpv1Q704Y3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpv1Q704Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms