Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ube2d2bQ6ZWY6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2d2bQ6ZWY6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2d2bQ6ZWY6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms