Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl35Q6ZWV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl35Q6ZWV7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms