Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ino80Q6ZPV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ino80Q6ZPV2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ino80Q6ZPV2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms