Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M2Q6W9L1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M2Q6W9L1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms