Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn5Q6VZZ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn5Q6VZZ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn5Q6VZZ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms