Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hsh2dQ6VYH9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hsh2dQ6VYH9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsh2dQ6VYH9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hsh2dQ6VYH9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms