Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Npc1l1Q6T3U4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npc1l1Q6T3U4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npc1l1Q6T3U4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.2 ms