Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc154Q6RUT8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc154Q6RUT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc154Q6RUT8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms