Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nudcd1Q6PIP5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nudcd1Q6PIP5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms