Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp1a3Q6PIC6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp1a3Q6PIC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms