Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcnip4Q6PHZ8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnip4Q6PHZ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms