Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scaf4Q6PFF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scaf4Q6PFF0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scaf4Q6PFF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 835.5 ms