Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dhx40Q6PE54 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dhx40Q6PE54 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dhx40Q6PE54 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms