Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM1

Txlna, Alpha-taxilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnaQ6PAM1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TxlnaQ6PAM1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TxlnaQ6PAM1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TxlnaQ6PAM1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms