Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp49Q6P9L4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp49Q6P9L4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp49Q6P9L4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms