Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcf1Q6P542 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms