Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fam222bQ6P539 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam222bQ6P539 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms