Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y8

Inpp4b, Type II inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Inpp4bQ6P1Y8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Inpp4bQ6P1Y8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Inpp4bQ6P1Y8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Inpp4bQ6P1Y8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms