Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SphkapQ6NSW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SphkapQ6NSW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SphkapQ6NSW3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SphkapQ6NSW3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms