Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fbxo41Q6NS60 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo41Q6NS60 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fbxo41Q6NS60 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fbxo41Q6NS60 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms