Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Smarca2Q6DIC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Smarca2Q6DIC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Smarca2Q6DIC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Smarca2Q6DIC0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms