Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdzrn3Q69ZS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pdzrn3Q69ZS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pdzrn3Q69ZS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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