Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msl2Q69ZF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Msl2Q69ZF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms