Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Cdk13Q69ZA1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cdk13Q69ZA1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdk13Q69ZA1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk13Q69ZA1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms