Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrrc8eQ66JT1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8eQ66JT1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8eQ66JT1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms