Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca4Q64444 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca4Q64444 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms