Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ScxQ64124 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ScxQ64124 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms