Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccpg1Q640L3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccpg1Q640L3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccpg1Q640L3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms