Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col4a5Q63ZW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col4a5Q63ZW6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a5Q63ZW6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a5Q63ZW6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms