Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vil1Q62468 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vil1Q62468 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vil1Q62468 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms