Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnrpcQ62241 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpcQ62241 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms