Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema5aQ62217 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema5aQ62217 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema5aQ62217 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms