Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctr9Q62018 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctr9Q62018 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctr9Q62018 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctr9Q62018 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms