Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pacsin1Q61644 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pacsin1Q61644 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pacsin1Q61644 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms